Blast是该领域中使用最频繁的应用程序之一。Blast有一个补丁使其在openMosix上运行更顺畅，但这并不是唯一的选择。
首先，这个补丁和Blast的其他版本存在一些已知问题。Blast有时会发生段错误，这通常发生在从互联网下载的预格式化数据库上。如果在原始数据库上运行formatdb，这些错误往往会消失。
除了openMosix blast补丁，很多人运行MPIBlast。鉴于openMosix可以加速MPI，将openMosix添加到此配置甚至可能为您带来更多的性能，但是我们需要进行一些额外的研究才能确认这一点。